1.专色颜色名称的统一。在不同的软件中，对于完全相同的两种套色，其名称可能会有所不同。如Free Hand把PANIONEI 1F5命名为PANTONE 1F5CVC或PANIONE 1F5CVV，而PageMaker中则命名为PANTONE 1F5CV。这样一来，当把FreeHand图形对象置入PageMaker中排版时，同样的颜色就会有三种名称，分色输出时就会产生三块印版，造成输出错误。所以，如果数据文件需要在两种以上的软件中使用，在整合后的分色输出前，一定要注意：必须统一相同专色的使用名称。较为常用的方法是以发排软件中的颜色名称为准，将相同专色的名称在各类软件的调色板中重新命名为统一的名称。
2.专色加网的角度。一般情况下专色都以实地方式印刷，很少做网点处理，所以一般很少提到专色加网的角度。但当使用套色的浅网色时，就会存在对专色网点加网角度的设计和修改问题。倘若有网点的专色跟其他网点印刷的颜色有叠印区域，就必须考虑专色加网的角度问题。此时，如果专色网点的加网角度与其他颜色加网角度形成的夹角小于30度，会出现撞网或产生龟纹；如果角度相互重叠，则会导致油墨叠印问题，这些都将造成印刷品颜色的严重失真。另外，专色的加网角度在软件中一般都会预设为45度（45度均被认为是人眼感知最舒服的角度，让网点排列在与水平和垂直线成相等角度的方向上可以减少人眼对网点的察觉能力），若是一个双色调影像或是数据文件中既有印刷四色黑成外（一般在四色加网印刷中，将黑网点放在45度，黄为0度、品红为15度、青为75度），又有专色，或者是有两个以上专色，则在分色加网时都会以45度输出，所以在对专色使用浅网时，如果有可能与其他加网颜色有叠印，则必须在分色输出时开启软件颜色设定或打印设定的对话框，对专色加网角度进行修改。
3.专色向印刷四色的转换。许多设计人员在做图文设计时往往会使用一些专色色库中的颜色来定义颜色和进行着色处理，而在分色时又把它们转换成CMYK的印刷四色。这时，需注意三点：一是专色色域大于印刷四色色域，在转换过程中，有些专色是无法完生保真的，而会丢失一些颜色信息；二是一定要在输出的选择“专色转换成为四色”选择，否则会导致输出错误；三是不要以为专色编号旁显示的CMYK颜色数值配比能让您以相同CMYK成分的印刷四色油墨再现出该专色的效果（如果可以就用不着专色了），事实上如果真是如法炮制，得到的颜色将在色相上有很大差距。
4.专色的陷印处理。由于专色不同于印刷四色（印刷四色油墨靠相互叠印生成间色，即其油墨具有透明性），使用时通常不会以两个专色的叠印生成一个间色，直观地说那会得到非常脏的颜色效果（当然也有例外，如在设计中有意使用专色叠印处理产生需要的、叠加混合产生的第三色，这种第三色颜色饱满、厚重而实在，比如：专色黄上压印调制的专色红，两种颜色叠印后产生一种稳重的深红色，常用作书的封面等），故定义专色的，一般不使用叠印（Overprint）方式而是采用让空（Keepaway）。这样在使用专色时，只要专色图形旁边有其他颜色，就应考虑做出适当的陷印处理，以防止露白边问题的发生（关于专色陷印的方法及其有关技术问题较为复杂，此不赘述）。
5.专色的颜色匹配系统。在选用计算机颜色匹配系统时，首先，应清楚哪些是专色系统，哪些是CMYK四色印刷系统，以此得知您所选用系统中的颜色在分色输出时是否会有颜色转换和是否会有色彩失真的情况发生。比如：图形软件中常用的颜色匹配系统有PANTONE、TRUMATCH、FOCOLTONE、TOYO Color Finder、ANPA-COLOR、RIC Color Guide等，其中TRUMATCH、FOCOLTONE和ANPA COLORR以印刷四色为基础发展而来的系统，其他的则都属于专色的系统（PANTONE系统则涵盖面较广，既有印刷色的，也有专色的）。
这也就是说，在PANTONE专色、TOYO Color Finder及RIC Color Guide等这些专色颜色匹配系统中，其中有许多颜色已经超出印刷四色色域，无法用四色油墨再现出来，系统提供的CMYK组合数值也只是近似值。所以如果您选择了专色颜色匹配系统中的颜色，而又以印刷四色分色输出；或者参考了专色在系统中近似显示的相应CMYK组合数值，并使用这些数值用印刷四色替换了原来的专色，结果肯定会导致色彩的失真；其次，应明白专色颜色匹配系统在做分色处理时，除非专门设定将专色转换成CMYK四色来输出，否则，每一个使用的专色都将自动被独立地分成一个色版。同样道理，印刷四色颜色匹配系统中的颜色用于着色处理后，在进行分色输出时也将会自动按照颜色本身的CMYK配比数值为到四个印版上，而不会产生更多的的色版。
